Equipes de Pesquisa

Conheça as 8 equipes multidisciplinares que desenvolvem soluções inovadoras

Equipe 1

Sequenciamento e Data Mining

Sequenciamento genômico e transcriptômico de espécies ameaçadas de extinção

Objetivos:

✓Sequenciar 25 espécies animais endêmicas do Brasil
✓Sequenciar 22 espécies de plantas ameaçadas de extinção
✓Usar plataforma PacBio HiFi (cobertura ~50X) e Illumina
✓Montar, anotar e catalogar genomas e transcriptomas

Equipe 2

Identificação de Alvos Moleculares

Utilização de IA e Machine Learning para descoberta de peptídeos

Objetivos:

✓Produzir banco de dados de peptídeos antimicrobianos
✓Utilizar LLM e Deep Learning para análise de sequências
✓Identificar alvos para diarreia aviária, mastite bovina, psilídeo, mancha alvo e ferrugem
✓Gerar 2000 peptídeos candidatos por alvo

Equipe 3

Síntese e Testes In Vitro

Síntese química e validação experimental de peptídeos

Objetivos:

✓Síntese de peptídeos pelo método Fmoc
✓Purificação por HPLC (>95% pureza)
✓Testes de afinidade por SPR
✓Avaliar atividade antimicrobiana, imunomodulação e citotoxicidade

Equipe 4

Análises Estruturais

Caracterização estrutural e mecanismo de ação dos peptídeos

Objetivos:

✓Caracterizar estrutura por dicroísmo circular (DC) e RMN
✓Avaliar mecanismo de ação com microscopia eletrônica
✓Análise de permeabilidade de membrana e formação de poros
✓Estudar fragmentação de DNA e apoptose

Equipe 5

Testes In Vivo

Validação em modelos animais e ensaios de campo

Objetivos:

✓Mastite bovina: ensaios em camundongos e 50 bovinos Girolanda
✓Diarreia aviária: testes em frangos de corte
✓Psilídeo Diaphorina citri: testes em plantas cítricas
✓Ferrugem asiática e mancha-alvo: testes em soja

Equipe 6

Formulações Nanotecnológicas

Desenvolvimento de sistemas de delivery avançados

Objetivos:

✓Nanopartículas inorgânicas (AuNPs, AgNPs, Fe3O4, SiO2)
✓Vesículas nanonaturais extracelulares
✓Caracterizar propriedades físico-químicas
✓Estudos de liberação modificada e prolongada

Equipe 7

Sistemas de Expressão

Produção em larga escala de peptídeos

Objetivos:

✓Vetores em bactérias (E. coli BL21 (DE3))
✓Vetores em leveduras (Pichia pastoris)
✓Otimizar expressão e purificação
✓Escalonamento para produção industrial

Equipe 8

Ensaios Clínicos e Campo

Validação em condições reais com parceiros industriais

Objetivos:

✓Mastite: 400 bovinos em fazendas leiteiras (Ourofino)
✓Diarreia aviária: 35 mil aves em aviário comercial
✓Psilídeo: ensaios em pomares cítricos (Ourofino, Valeouro, BASF)
✓Ferrugem e mancha-alvo: testes em campo com múltiplas repetições

Apoio estratégico

Metodologia de Pesquisa

Sequence-Based

Modelos LLM e Deep Learning para análise de sequências biológicas, geração de peptídeos candidatos e integração com AlphaFold.

Structure-Based

Modelos generativos como RF Diffusion para otimizar estruturas e peptídeos com base em interações com alvos específicos.

De Novo

Combinação de técnicas structure-based e sequence-based para criar novos peptídeos inovadores.

Ferramentas de IA Utilizadas

Machine Learning

• Large Language Models (LLM)
• Deep Learning (MLPs, RNNs)
• Deep Reinforcement Learning (DRL)
• Modelos de Difusão

Análises Computacionais

• AlphaFold para predição de estruturas
• RF Diffusion para otimização
• Docking molecular
• Simulações de dinâmica molecular

Doenças Alvo

Doença

Mastite Bovina

Setor

Laticínios

Perda

45% da produção

Patógeno

Staphylococcus aureus

Doença

Diarreia Aviária

Setor

Avicultura

Perda

30%

Patógenos

5 bactérias

Doença

Ferrugem Asiática

Setor

Agricultura

Perda

até 90%

Patógeno

Phakopsora pachyrhizi

Doença

Greening dos Citros

Setor

Citricultura

Perda

24%

Vetor

Diaphorina citri

Doença

Mancha-alvo

Setor

Agricultura

Cultura

Soja

Patógeno

Corynespora cassiicola

Quer Saber Mais Sobre Nossas Equipes?

Conheça os pesquisadores que compõem cada equipe e seus projetos específicos